Os mandantes saíram na frente ainda no primeiro tempo com gol marcado pelo atacante Léo Jacó. Já aos 32 minutos da segunda etapa, Vinícius empatou o jogo para o Náutico, e Igor Fernandes consumou a virada quatro minutos depois.
O clube alvirrubro volta a campo pela Série B no próximo sábado (4), quando receberá a Ponte Preta nos Aflitos. O Atlético-GO, por sua vez, agora acumula duas derrotas na competição e enfrentará na próxima rodada o Vila Nova fora de casa, também no sábado.